Как так? Скорее всего одна заборная, вторая выходная. Ставить нужно на заборную.
Если хорошо настроить скиммер, а у нормальных скиммеров есть регуляторы, то не стоит волноваться.
Ну, это просто внутренние фильтра с интегрированными скиммерами. Ну или скиммера с интегрированными внутренними...