Не стабильность подачи СО2 может привести к нитчатке.
Ну а бурые - это как следствие перезапуска, затенение от их не спасёт! Сифонь где можешь, руками счищай и собирай сифоном, при нормальном свете они сойдут быстро.
Ну и кормление по меньше, на минимум пока бурые не уйдут, а нитчатку - мотать...